ubuntu 14.04 tinker 7.1 fftw3.3.4 compile gfortran gcc 安装 儿子的papa

meatball1982

要用tinker
之前有安，记录的帖子上不去了。重新整，一个晚上，还好有万能XPP。鸣谢。

附件是安装过程的记录。我是fish，记忆力不行。
下面是记录的tex，可以自己生成pdf，附件也可以看。

1. \subsubsection{安装tinker}
   
2. 
   
3. \subsubsection{需要的工具}
   
4. mod : 2016年 04月 21日 星期四 08:55:02 CST\\
   
5. 
   
6. 编译tinker
   
7. \begin{verbatim}
   
8. ubuntu 14.04
   
9. gcc
   
10. gfortran
    
11. fftw3.3.4
    
12. tinker 7.1
    
13. \end{verbatim}
    
14. 
    
15. tinker放在
    
16. /home/mm/softs/tinker/tinker
    
17. 下
    
18. fftw3.3.4放在
    
19. 
    
20. /home/mm/softs/fft3/fftw-3.3.4
    
21. 下
    
22. 
    
23. 
    
24. tinker 中的fftw.3.3不好用.自己编译一个其它的.
    
25. \subsubsection{编译fftw3.3}
    
26. 编译fftw3.3.4
    
27. \begin{verbatim}
    
28. ./configure -prefix=/home/mm/softs/fft3/fftw-3.3.4
    
29. -enable-threads FC=gfortran CC=gcc
    
30. 
    
31. make
    
32. 
    
33. sudo make install
    
34. 
    
35. \end{verbatim}
    
36. 
    
37. 注意:
    
38. 第３步的sudo是必要的.
    
39. 不能少.
    
40. 如果安装成功的话,在当前目录下,有一个lib文件夹,里面会有
    
41. libfftw3.a和$libfftw3\_threads.a$
    
42. 和一堆其它的文件.将这两个文件copy 到tinker目录下的source目录下.
    
43. 
    
44. \subsubsection{编译tinker}
    
45. 在tinker的目录下,有linux, windows,mac***等一堆的,分别是各种操作系统下的安装(compile)脚本.我用的是linux下的gfortran文件夹.将这一文件夹下的$*.make$文件copy到
    
46. \begin{verbatim}
    
47. tinker/source
    
48. \end{verbatim}
    
49. 
    
50. 在tinker的目录下生成一个bin文件夹。
    
51. 
    
52. \begin{verbatim}
    
53. mkdir bin
    
54. \end{verbatim}
    
55. 
    
56. 在compile之前,要修改initial.f文件.
    
57. 注意,如果不作,会出现
    
58. \begin{verbatim}
    
59. libtinker.a(initial.o) ......
    
60. kmp-set-blocksize_s_
    
61. \end{verbatim}
    
62. 
    
63. 的错误,那是因为默认是intel的fortran的编译器.
    
64. 将
    
65. initial.f中的
    
66. \begin{verbatim}
    
67. call kmp_set_stacksize_s (2**28)
    
68. call kmp_set_blocktime (0)
    
69. \end{verbatim}
    
70. 这两行给注释掉\footnote{这个过程在0READ中有说明，不是intel的fortran编译器，注释两行，大体是这个意思}。
    
71. 
    
72. 
    
73. \begin{verbatim}
    
74. ./compile.make
    
75. \end{verbatim}
    
76. 
    
77. 这个比较花时间,如果成功，会出现一堆的*.o和*.mod文件。
    
78. 
    
79. 然后是
    
80. \begin{verbatim}
    
81. ./library.make
    
82. \end{verbatim}
    
83. 
    
84. 然后
    
85. \begin{verbatim}
    
86. ./link.make
    
87. \end{verbatim}
    
88. 没问题的话，会出现一堆的*.x文件　。
    
89. 
    
90. 然后是
    
91. \begin{verbatim}
    
92. ./list.make
    
93. \end{verbatim}
    
94. 
    
95. 这个似乎是没什么用的。
    
96. 
    
97. 
    
98. \begin{verbatim}
    
99. ./rename.make
    
100. \end{verbatim}
     
101. 这就是把生成　好的可执行文件放在bin下了。
     
102. 
     
103. 
     
104. 最后，还要告诉系统tinker被放在哪了。
     
105. 
     
106. \begin{verbatim}
     
107. vi ~/.bashrc
     
108. export PATH=/home/mm/softs/tinker/tinker/bin:$PATH
     
109. source ~/.bashrc
     
110. \end{verbatim}
     

复制代码

meatball1982

gfortran

1. add-apt-repository ppa:ubuntu-toolchain-r/test
   
2. apt-get update
   
3. apt-get install gfortran

复制代码

meatball1982

copy gfortran/*.make tinker/source

meatball1982

注意：
ubuntu 16.04
fftw3.3.7

用

1. ./configure --prefix=/home/mm/softs/fft3/fftw-3.3.4
   
2. --enable-threads FC=gfortran CC=gcc

复制代码