pymol 生成 alpha helix 螺旋

meatball1982

需要作一些工作,　要一个alpha  helix.其中所有的氨基酸都是ala.

找了一下,用pymol生成.
打开
pymol

build -> residue -> helix

注意,这时,是什么也不会有的.
继续,
build -> residue -> alanine
build -> residue -> alanine
build -> residue -> alanine
...
build -> residue -> alanine

总共重复10次(至少８次).就行了.如果你要生成一个其它的,比如中间有一个ser之类的.就把alanine换成ser就行.
build 一个,就出现一个残基.下图是两个helix,中间是3个ser.