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标题: 豆粑粑 macos install graph-tool no module [打印本页]
作者: meatball1982    时间: 2020-3-27 22:11
标题: 豆粑粑 macos install graph-tool no module
本帖最后由 meatball1982 于 2020-3-27 22:37 编辑

In macos, I use brew install graph-tool
Finished, But in python

from graph_tool.all import *


no module

According to

https://blog.csdn.net/pt9927/article/details/74977853


通过homebrew和以往通过pip安装的包不在同一个目录中，所以电脑里出现了两个site-packages文件夹
为了让python能使用homebrew安装的graph_tool，需要把homebrew的site-packages路径添加到python的sys.path路径中

依然是在终端中，输入以下两条命令：

mkdir -p /Users/liyan/Library/Python/3.7/lib/python/site-packages

echo ‘import site; site.addsitedir(“/usr/local/lib/python3.7/site-packages”)’ >> /Users/liyan/Library/Python/3.7/lib/python/site-packages/homebrew.pth

命令中的“liyan”是我电脑的名字，需要根据自己电脑的名称进行修改

上面这些操作是创建了一个位于
/Users/liyan/Library/Python/3.7/lib/python/site-packages 的文件 homebrew.pth，指向 /usr/local/lib/python3.7/site-packages，内容为：import site; site.addsitedir(“/usr/local/lib/python3.7/site-packages”)

完成以上所有步骤之后重新打开终端，在终端中输入python，进入python交互界面，然后输入：

>>> from graph_tool.all import *


注意，我暂时只能在
[backcolor=rgba(0, 0, 0, 0.9)]/usr/local/lib/python3.7/site-packages

这里python好用。
应该还是lib的路径的问题。

非常感谢这个大神。
原文链接：https://blog.csdn.net/pt9927/article/details/74977853

作者: meatball1982    时间: 2020-3-29 11:23
本帖最后由 meatball1982 于 2020-3-30 10:55 编辑

要还是不行，就在你每次运行的 code之前，在python 的前端加入。

  1. >>> import site
  2. >>> site.addsitedir("/usr/local/lib/python3.7/site-packages")
  3. >>> from graph_tool.all import *
复制代码

作者: meatball1982    时间: 2020-3-30 10:54
本帖最后由 meatball1982 于 2020-3-30 13:22 编辑

在ubuntu 下，我这里是18.10
  1. conda create --name gt -c conda-forge graph-tool
  2. conda activate gt
复制代码
这是生成一个独立的环境，专门用于graph-tool。

  1. conda install -n gt -c conda-forge ipython jupyter
复制代码



之后，每次需要运行graph-tool之前，
要
  1. conda activate gt
复制代码
相当于启动这个环境，剩下就是用就可以了。



如果安装完了，还要你
conda init bash
而且运行了也没用。
那就
vi ~/.bashrc
把
conda相关的内容，一般是# anaconda那附近的或下面的，都放到~/.bashrc最一开始。
再source ~/.bashrc
一下，就可以
conda activate gt
了。
我参考的是
https://stackoverflow.com/questi ... hrough-shell-script
这个帖子。


如果不想用这个环境，
  1. conda deactivate
复制代码







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