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标题: 豆粑粑 matlab 图形表达相互作用， H bond [打印本页]

作者: meatball1982 时间: 2020-1-10 11:37
标题: 豆粑粑 matlab 图形表达相互作用， H bond
本帖最后由 meatball1982 于 2020-1-10 11:41 编辑

帮忙同事画个图，结果不小心画上瘾了。一点点的修改，整整画了三天，才基本让自己满意。

一个是蛋白质，一个是核酸。要表达蛋白质中的氨基酸中的原子和核酸中的ACGU中的原子之间形成H 键的概率（也可以是相互作用能，相互ele,相互vdw，总之就是相互的东西，都能搞）

因为蛋白质中氨基酸比较多，其中可能有用的原子也不少，但真正出现HBond的却不多。所以把所有的可能以2D矩阵的形式表达出来，而有值的点，通过圆的半径，color和透明度同时表达。

其中，关键的原子，用不同的color有标注，对就着线指向坐标。

具体的，运行
work_plot_HB.m

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作者: meatball1982 时间: 2020-1-14 13:14
本帖最后由 meatball1982 于 2020-1-14 13:19 编辑

更新一下，为了使key的位置更加的明显，我通过text 的形式，将key部分的字体进行了放大。
用到了一个对key位置的重新排序方法。具体，运行
work_bat_plot.m

4post.tar

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