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标题: pymol 生成 alpha helix 螺旋 [打印本页]

作者: meatball1982 时间: 2016-2-23 14:58
标题: pymol 生成 alpha helix 螺旋
本帖最后由 meatball1982 于 2016-2-23 15:03 编辑

需要作一些工作,　要一个alpha helix.其中所有的氨基酸都是ala.

找了一下,用pymol生成.
打开
pymol

build -> residue -> helix

注意,这时,是什么也不会有的.
继续,
build -> residue -> alanine
build -> residue -> alanine
build -> residue -> alanine
...
build -> residue -> alanine

总共重复10次(至少８次).就行了.如果你要生成一个其它的,比如中间有一个ser之类的.就把alanine换成ser就行.
build 一个,就出现一个残基.下图是两个helix,中间是3个ser.

ala20.png (17.43 KB, 下载次数: 991)

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